La plupart des informations utilisées concernant les organismes ou les données de cette étude proviennent du lien situé en bas de la page d’aide “urchin_bio”.

Introduction

Dans cette étude, nous allons retrouver deux types d’oursins Paracentrotus lividus. Le premier type d’oursin est issu de la pêche, les individus ont été pêchés en Brettagne, en France. Le deuxième type d’individus provient d’une ferme de culture en Normandie, en France. Ces individus-ci sont issus de fécondation artificielle en laboratoire avec des fécondations croisées de première (F1) ou deuxième (F2) génération d’oursins collectés sur le terrain. Les oursins Paracentrotus lividus sont présents tout le long de la côte européenne depuis la côte nord-atlantique irlandaise à la mer Méditerranée.

But

Notre but est de comprendre l’impact de l’origine et du sexe sur le développement des oursins Paracentrotus lividus.

Matériel et méthodes

Les données ont été acquises suite à un travail réalisé par P. GROSJEAN, C. SPIRLET, P. GOSSELIN, D. VAÏTILINGON et M. JANGOUX1. Dans ce travail, les chercheurs ont analysés plusieurs variables (comme le poids total, la taille, le poids du squelette,…). Pour récolter ces données, ils ont travaillés sur plusieurs oursins Paracentrotus lividus dont les origines ont été annoncées ci-dessus. Un protocole précis a été appliqué pour collecter les données des différentes variables (comme le séchage des gonades, par exemple). Pour traiter ces information nous utilisons RStudio, un logitiel de développement avec le language R.

Résultats

Masse du skelette sur la masse total

# pour suprime les valeurs manquantes d'un tableau: drop_na(urchin, sex)
  chart(data = urchin, skeleton ~ weight %col=% origin %shape=% sex) +
  geom_point()
## Warning: Removed 287 rows containing missing values (geom_point).

# code avec l'aide d'assistant

On voit clairement que la densité de masse du squelette sur la masse est plus importante chez les individus pêché en mer que ceux de culture. ## Comparaison de la masse des gonades.

chart(data = urchin, origin ~ gonads %fill=% origin) +
  geom_violin() +
  coord_flip()
## Warning: Removed 1 rows containing non-finite values (stat_ydensity).

Ce graphique représente la masse des gonades en fonction de l’origine. On peut voir que la masse des gonades va de 0 à 10 g pour les individus de pêcherie alors qu’il va de 0 à 16 g pour les individus de culture. Malgré cela, la plupart des individus, qu’ils soient de culture ou de pêcherie, ont des gonades qui ont un poids entre 0 et 4 g.

Taille et maturité probable de nos oursin

chart(data = urchin, ~ height %fill=% sex) +
 geom_histogram(bins = 15) +
 ylab("Effectifs")

Ce graphique représente la hauteur du test en mm selon le sexe en fonction du nombre d’effectifs. Nous pouvons logiquement observer que les individus prématurés possèdent les plus petites tailles et que notre population est jeune. Le graphe affiche que les individus mâles sont généralement plus grands que les autres individus. Nous pouvont donc considérée que les oursins avec le sexe non identifier sont des prématurés.

Discussion

Conclusion